188bet体育_188bet亚洲体育_点此进入 в?третий раз собрал специалистов в?области биоинформатики

Задача конференции?— собрать на?одной площадке людей, которые создают программные продукты для работы с?современными биологическими данными, и?людей, которым они нужны. В?этом году на?ее?площадке встретились более 100 специалистов в?области биоинформатики и?алгоритмической биологии.

В?этот раз BiATA прошла как ассоциированная конференция VII Съезда Вавиловского общества генетиков и?селекционеров (ВоГИС).

Для нас приглашение декана биологического факультета 188bet体育_188bet亚洲体育_点此进入, академика РАН Игоря Тихоновича присоединиться к Съезду ВоГИС является признанием высокого уровня нашей конференции, хотя ей?всего два года.

Профессор кафедры цитологии и?гистологии Санкт-Петербургского государственного университета, председатель программного комитета конференции, заместитель директора Центра алгоритмической биотехнологии Института трансляционной биомедицины 188bet体育_188bet亚洲体育_点此进入?Алла Лапидус

Бесспорным подтверждением высокого научного уровня конференции является участие в?ней ведущих ученых, среди которых микробиолог Роб Найт, профессор Калифорнийского университета в?Сан-Диего, соучредитель проекта ?Микробиом Земли?. ?Его ангажируют на?научные мероприятия на?три года вперед. Однако на?BiATA Роб Найт приезжает второй год подряд. Я?горжусь этим. Такой известный ученый не?поехал?бы второй раз туда, где ему не?интересно. Четверо ученых, которые не?смогли приехать сейчас, уже дали согласие на?участие в?конференции в?следующем, 2020?году. Мы?считаем это признанием?,?— говорит Алла Лапидус.

В?этом году большое внимание на?конференции уделено продвижению биоинформатики в?сельское хозяйство. В?связи с?этим большая часть докладов посвящена задачам метагеномики, помогающей изучать микробиоту почвы, растений, продуктов питания и?человека.

Так, Евгений Андронов из?Всероссийского НИИ сельскохозяйственной микробиологии рассказал о?том, как можно применять на?практике данные по?почвенному микробиому. В?частности, о?том, как использовать ?естественную инженерию?, обеспечивающую высокую эффективность взаимодействия растений и?микроорганизмов.

Одним из?докладов секции, посвященной алгоритмам сборки геномов, было выступление Александра Шлемова из?Центра алгоритмической биотехнологии 188bet体育_188bet亚洲体育_点此进入 о?новом инструменте PathRacer. При секвенировании генома молекула ДНК разрезается на?множество небольших отрезков, которые потом нужно собрать обратно. Сборка генома?— сложный процесс, который никогда не?проходит без ошибок. По?словам Аллы Лапидус, разработанный университетскими биоинформатиками новый программный продукт PathRacer предлагает новый подход повышения качества сборки и?аннотации геномов.

Обычно при секвенировании геном разрезается на?очень мелкие части, но?есть технологии, позволяющие работать с?более крупными фрагментами, что дает возможность снизить число ошибок при сборке генома. Однако при работе с?большими участками генома требуются другие математические решения. SPAligner (Saint Petersburg Aligner), о?котором рассказал Дмитрий Антипов из?Центра алгоритмической биотехлогии 188bet体育_188bet亚洲体育_点此进入,?— еще один новый инструмент, позволяющий делать сборку генома более точной, но?предназначенный для работы с?длинными последовательностями.

Пилар Францино, руководитель направления геномики и?здравоохранения FISABIO (Фонд общественного здравоохранения Валенсии по?содействию здоровью и?биомедицинским исследованиям), в?своем выступлении затронула очень интересную тему?— как микробиота влияет на?течение беременности и?что происходит с?микрофлорой в?первые месяцы жизни ребенка. Как известно, микробиота оказывает колоссальное влияние на?здоровье на?протяжении всей жизни. Чем больше мы?знаем о?том, каким образом она формируется и?что происходит на?самых ранних стадиях ее?развития, тем лучше будем понимать, что приводит к?тем или иным патологическим состояниям, связанным с?нарушениями в?составе микрофлоры.