Как на духу… со Стефаном О’Брайеном
В?журнале ?Nature Medicine? опубликовано интервью с?научным руководителем лаборатории биоинформатики 188bet体育_188bet亚洲体育_点此进入, победителем конкурса мегагрантов О’Брайеном Стефаном Джеймсом .
В?Национальный раковый институт США (НРИ) Стефан О’Брайен попал будучи начинающим ученым в?1971. Ему удалось дорасти до?должности заведующего лабораторией Геномного Многообразия, на?которой он?проработал 25?лет. Однако, проведя 40?лет на?службе в?государственном учреждении, доктор О’Брайен готов был взяться за?что-нибудь новое.
В?декабре 2011 года он?ушел со?своей должности в?НРИ и?возглавил один из?проектов мегагрант Российской Федерации, программы, начавшейся годом ранее и?разработанной Министерством Образования и?Науки для привлечения выдающихся ученых для работы в?России и?возглавления 3-летних проектов, на?каждый из?которых правительство выделило 150 миллионов рублей. Выделенные ему 150 миллионов доктор О’Брайен направил на?создание Центра Геномной Биоинформатики при Санкт-Петербургском государственном университете.
Хотя доктор О’Брайен специализируется по?большей части на?исследованиях рака, его научные интересы куда шире. В?частности, он?возглавлял группу исследователей, обнаружившую мутацию CCR5-?32, который обуславливает устойчивость к?ВИЧ, а?также участвовал в?открытии удивительного генетического сходства чит в?Африке. В?недавнем прошлом он?и?еще двое ученых из?Калифорнии создали проект Genome 10K, целью которого является сиквенирование 10?тысяч видов позвоночных.
Во?время одной из?своих поездок в?США доктор О’Брайен рассказал Илаю Долджину (Elie Dolgin, известный научный обозреватель?— прим. переводчика) о?том, как сравнительная геномика и?новый геномный центр в?России помогут в?поиске новых лекарств.
Почему Вы?решили уйти из?НРИ?
Многие годы НРИ поддерживал мои исследования. Но?в?какой-то момент организация начала перестаиваться на?другие направления и?ей?нужны были новые руководящие кадры. Некоторые из?членов администрации решили, что сравнительная геномика не?столь важна, нежели повторное сиквенирование опухолей человека. Хотя я?с?большим уважением отношусь к?проекту Геномного Атласа Рака, он?все?же игнорирует тот факт, что практически все в?современной биологии мы?почерпнули из?исследований животных. Мне не?хотелось ввязываться в?споры о?том, что важнее в?рамках одной организации. Хотелось больше свободы и?возможностей, чем я?мог получить в?государственном учреждении. Да?и?после почти 40?лет работы в?НРИ не?хотелось закончить карьеру всю жизнь находясь на?госслужбе.
Вы?уже год как в?новой должности. Есть?ли успехи?
Успехи, безусловно, есть. Пару месяцев назад мы?переехали в?помещение Центра, оснащенное высокопроизводительными компьютерами. Сейчас в?команде около 20?преимущественно молодых ученых с?отличными навыками в?области программирования и?математики. Кроме того, у?меня много связей на?международном уровне со?многими центрами, занимающимися сиквенированием.
Занимаясь сравнительной геномикой, Вы?делаете больше упор на?сохранение исчезающих видов или на?исследования в?области болезней человека?
Это взаимосвязанные вещи, на?мой взгляд. Мне кажется, что чем лучше мы?понимаем развившиеся адаптации и?специализации, а?также механизмы выживания у?животных, тем больше у?нас знаний о?том, как поддерживать баланс сред обитания и?экосистем, и?тем больше у?нас шансов обнаружить полезные адаптации и?затем применить их?в?развитии фармакологии. К?примеру, любопытный факт: у?акул и?голых землекопов не?бывает раковых опухолей. В?связи с?этим важно понять, какие генетические адаптации за?это отвечают. За?счет чего у?пеликанов зрение лучше, чем у?людей, и?как полученные в?ходе исследования данные можно в?будущем применить для улучшения зрения у?людей. Или: за?счет чего обезьяны в?Африке резистентны к?смертоносным инфекциям типа ВИЧ. Адаптации, встречающиеся у?животных, являются предметом изучения описательной биологии, а?теперь у?нас есть возможность сопоставить разницу в?геномах видов и?существующие у?них адаптации.
Что побудило Вас назвать Центр в?честь Добржанского?
Когда я?40?лет назад начала работать в?НРИ, генетиков было еще очень мало. Один из?коллег спросит меня тогда: ?Зачем заниматься генетикой, если никаких результатов кроме прояснения, в?какой хромосоме находится ген, все равно нет?? Все казалось, что все, чем занимается генетик, это поиск расположения генов в?хромосомах. Сейчас генетиков пруд пруди, такой она стала важной. Добржанский первым подчеркнул важность учета точки зрения эволюционной биологии в?любом исследовании. Вот его знаменитая цитата: ?Ничто в?биологии не?имеет смысла кроме как в?свете эволюции?.
В?адрес мегагрантов высказывалось много критики в?связи с?бюрократическими проволочками. Столкнулись?ли Вы?с?этой проблемой?
Мне кажется, в?начале работы программы в?2012 году дела обстояли хуже, чем сейчас. Когда я?начал свой проект, многие проволочки уже были устранены. Среди них и?тендеры, из-за которых закупки затягивались на?6–8?месяцев. Когда начался наш проект, мы?закупили огромное количество оборудования буквально за?2?недели. Посмотрел?бы, как?бы Вам такое удалось в?НРИ!
Что Вы?думаете о?системе финансирования в?России?
Везде есть свои плюсы и?минусы. В?США, к?примеру, многие ученые на?пике своей карьеры вынуждены 50–60?% своего времени тратить на?написание грантовых заявок. Мне повезло, что в?НРИ финансирование вертикальное, где я?как заведующий получал на?распределение ресурсы, выделенные организацией, а?ученые могли спокойно заниматься своими исследованиями. К?счастью, сходным образом обстоит дело в?Российских университетах. В?общем и?целом, в?России талантливые и?заинтересованные в?научной деятельности ученые могут вести исследования, не?опасаясь того, что им?раз за?разом придется тратить время на?написание грантовых заявок. Я?не?хочу сказать, что в?России все идеально, но?все?же есть чему поучиться и?у?этой системы.
Вы?еще не?разочаровались в?решении поехать работать в?Россию?
Когда в?октябре Марк Цукерберг приехал в?Россию с?той?же целью?— найти талантливых программистов?— я?еще раз убедился в?правильности принятого мной решения.
О?Стефане О’Брайене
Стефан О’Брайен?— генетик, научный руководитель лаборатории биоинформатики 188bet体育_188bet亚洲体育_点此进入, победитель конкурса мегагрантов по?Постановлению Правительства РФ №?220.
- возглавляет лабораторию генетического разнообразия в?Национальном институте злокачественных новообразований (США)
- известен своими исследованиями в?области генетики человека, эволюционной биологии, ВИЧ/СПИД, вирусологии, сохранению видов
- является членом Американской академии искусств и?наук;
- был председателем Международного комитета по?составлению генетической карты для организации ?Геном человека?
- основал и?является одним из?руководителей NOAHS (Новые возможности в?науке о?здоровье животных)?— консорциума ученых, входящего в?Смитсоновский институт?/ Национальный зоологический парк, занимающегося применением биомедицинских технологий для сохранения видов и?подготовкой ученых, специализирующихся по?этой тематике