Абсолют ТВ: Ученые 188bet体育_188bet亚洲体育_点此进入 открыли способ поиска новых антибиотиков с Natural Products
Международная группа ученых-биоинформатиков разработала программу Dereplicator, которая позволяет упростить и ускорить поиск продуктов жизнедеятельности бактерий, которые являются потенциальными антибиотиками, противоопухолевыми или противовирусными препаратами. Об этом сообщает пресс-служба 188bet体育_188bet亚洲体育_点此进入.
Активное участие в этой работе приняли младшие научные сотрудники 188bet体育_188bet亚洲体育_点此进入?Алексей Гуревич?и?Алла Михеенко. Разработка инструмента проводилась и на базе лаборатории ?Центр алгоритмической биотехнологии? 188bet体育_188bet亚洲体育_点此进入, которой руководит?Павел Певзнер.
Что такое программа Dereplicator?
Программа Dereplicator позволяет ученым сравнивать имеющиеся базы химических структур продуктов жизнедеятельности микроорганизмов (Natural Products) с входными данными в виде масс-спектров тех веществ, которые интересуют исследователя в данный момент. Инструмент определяет, какие химические соединения из новых входных данных уже содержатся в базе известных Natural Products.
Таким образом, ?в разы уменьшается объем поиска тех веществ, которые потенциально могут стать новыми антибиотиками. Сегодня разработка новых антибактериальных препаратов является одной из приоритетных задач современной науки.
Уникальность программы Dereplicator
Уникальность нового программного продукта - обработка более сложных структур — циклических и разветвленных. Ученым 188bet体育_188bet亚洲体育_点此进入 удалось усовершенствовать программу и сделать ее доступной для широкого круга пользователей.
Была разработана веб-версия продукта, которой могут пользоваться ученые всего мира, для этого им необходимо лишь зарегистрироваться на платформе GNPS.
Биоинформатики Санкт-Петербургского университета также значительно увеличили скорость работы инструмента. Если в сентябре 2015 года запуск первой версии программы платформе GNPS занимал неделю, то сегодня программа Dereplicator способна обработать такое же количество данных за четыре часа.