Ученые 188bet体育_188bet亚洲体育_点此进入 секвенировали геном байкальской нерпы
Биологи Санкт-Петербургского университета в составе международного коллектива впервые описали геном единственного млекопитающего озера Байкал — байкальской нерпы.
Байкальская нерпа?— один из?трех видов нерп, живущих в?пресной воде, это единственное млекопитающее озера Байкал?— самого глубокого озера на?планете. В?конце прошлого века из-за чумы плотоядных численность нерпы сильно сократилась (до?100 тысяч голов), однако в?последние годы она постепенно восстанавливается. Как отмечают ученые, секвенирование генома животного в?будущем позволит обеспечить постепенный рост популяции, поскольку гены животного хранят всю информацию об?истории отдельных видов и?особей. Такой подход поможет учитывать, в?каких условиях животные лучше всего выживают.
Результаты исследования опубликованы в?одном из?лучших научных журналов в?области генетики Genes.
?Эта идея появилась более десяти лет назад в?рамках международного проекта Genome 10K 100к по?инициативе тогда работавшего руководителем Центра геномной биоинформатики 188bet体育_188bet亚洲体育_点此进入 имени Ф.?Г.?Добржанского 188bet体育_188bet亚洲体育_点此进入 Стива О’Брайена. Суть проекта заключалась в?том, чтобы секвенировать геномы 100 тысяч живых организмов, в?их?числе оказалась и?байкальская нерпа?,?— рассказала профессор кафедры цитологии и?гистологии 188bet体育_188bet亚洲体育_点此进入, директор Центра алгоритмической биотехнологии 188bet体育_188bet亚洲体育_点此进入 Алла Лапидус.
Проект затянулся из-за недостатка ресурсов и?сложности ДНК байкальской нерпы. Первая версия, разработанная учеными, оказалась лишь набором отдельных фрагментов, упорядочить которые было крайне сложно из-за большого числа повторяющихся участков. Эту проблему удалось решить, используя новый метод Hi-C, что позволило ученым 188bet体育_188bet亚洲体育_点此进入 достичь цели и?секвенировать геном байкальской нерпы.
Подробнее о?проведенной работе по?секвенированию генома байкальской нерпы читайте в?ближайшем номере журнала ?Санкт-Петербургский университет?.
?Метод Hi-C позволяет определить последовательности ДНК, которые физически находятся близко друг к?другу в?клетке. Обладая такой информацией, мы?можем упорядочить имеющиеся у?нас фрагменты, собрав их?в?полные хромосомы?,?— объяснил старший научный сотрудник Центра алгоритмической биотехнологии 188bet体育_188bet亚洲体育_点此进入 Михаил Райко.
Благодаря секвенированию генома байкальской нерпы ученые Университета смогли понять ее?происхождение и?родственные связи, а?также генетическое разнообразие популяции?— ключевую характеристику для природоохранных видов, к?которым относится байкальская нерпа. Так, отсутствие вариабельности, то?есть генетического разнообразия, может ставить под угрозу само существование видов.
Санкт-Петербургский государственный университет?— первый университет России?— был основан 28?января (8?февраля) 1724?года, когда Петр I?издал указ об?учреждении Университета и?Российской академии наук. Сегодня 188bet体育_188bet亚洲体育_点此进入?— научный, образовательный и?культурный центр мирового уровня. В?2024 году Санкт-Петербургский университет отметит свой 300-летний юбилей.
План мероприятий в?рамках празднования юбилея Университета был утвержден на?заседании оргкомитета по?празднованию 300-летия 188bet体育_188bet亚洲体育_点此进入, который провел заместитель председателя Правительства РФ?Дмитрий Чернышенко. Среди таких мероприятий?— присвоение малой планете имени в?честь 188bet体育_188bet亚洲体育_点此进入, выпуск банковских карт со?специальным дизайном, создание почтовых марок, посвященных истории первого университета России, брендирование самолета авиакомпании ?Россия? и?многое другое. Кроме того, Университет запустил сайт, посвященный предстоящему празднику, с?информацией о?выдающихся универсантах, научных достижениях и?подробностях подготовки к?юбилею.
Еще один важный вопрос, на?который в?перспективе смогут ответить ученые благодаря данному исследованию,?— происхождение нерпы. В?настоящее время существует теория, что около трех миллионов лет назад нерпа мигрировала с?побережий Северного Ледовитого океана на?юг?по?рекам. Таким образом она оказалась в?Байкале, который позднее оказался отделен от?соленых водоемов.
Кроме того, данное исследование позволит ученым сравнить геном байкальской нерпы с?другими представителями северной фауны и?другими видами нерп, живущих в?пресных водоемах, и?определить, в?какой момент популяции разделились.